化痰，开窍，健脾，利湿。治癫痫，惊悸健忘，神志不请，湿滞痞胀，泄泻痢疾，风湿疼痛，痈肿疥疮。①《别录》："主食诸虫。"②陶弘景："主风湿咳逆，去虫，断蚤虱。"③《本草图经》："捣末，油调涂疥瘙。"④《岭南采药录》："健胃除湿，煎水洗疥癞。"⑤《贵州民间方药集》："助消化，消积食，止腹痛，治痢疾，又治风湿疼痛。"⑥《东北药植志》："散痈肿。"⑦《上海常用中草药》："镇静安神，化痰，健胃。治癫痫，耳鸣，听觉不灵，胸腹胀闷。"⑧《吉林中草药》："芳香通窍，和中辟浊。治神昏，耳鸣，健忘，湿滞气塞。"
①治健忘、惊悸、神志不清：菖蒲三钱，远志三钱，茯苓三钱，龟版五钱，龙骨三钱。共研细末。每次一钱五分，每日三次。（《山东中草药手册》）②治腹胀，消化不良：菖蒲、莱菔子（炒）、神曲各三钱，香附四钱，水煎服。（《山东中草药手册》）③治痢疾，泻黑水，里急后重，头昏眼花：水菖蒲根一钱，切细，冷开水吞服，一次服用，连用二剂。（《贵州民间方药集》）④治痈肿初起：菖蒲一两，独活五钱，白芷五钱，赤芍五钱，紫荆皮三钱。研细末，取适量药末同葱心捣成糊状，敷患处。（《吉林中草药》）⑤治牙痛，牙龈出血：菖蒲适量，研末，外搽。（《山东中草药手册》）⑥治小儿疝气，偏坠，阴部湿疮：菖蒲煎水，洗患处。（《吉林中草药》）
①治疗慢性气管炎
据150余例的观察，有效率在90％上下，显效率达45～50％左右。对咳、喘、痰、炎均有一定疗效。一般起效时间在服药后3～6天，快者1～2天；且疗效比较持久，不少治愈病例经冬季考验，未见复发。实践中观察到，臭蒲制剂对虚寒型疗效较好，痰热型较差；单纯型疗效略高于喘息型；疗程增加，显效率明显上升，而复发率降低，但有效率却变化不大。制剂及用法：㈠胶囊.每粒装臭蒲根粉0.3克。每次2粒，日服2～3次。㈡注射液：每毫升相当臭蒲根生药1克。每日1次2毫升肌肉注射。均10天为一疗程。初步观察，注射剂似较口服制剂效果为好；但口服制剂加用其它药物组成复方治疗，则疗效有所提高。副作用：口服制剂偶见恶心、呕吐、腹鸣等胃肠道反应，停药后可自行消失。
②治疗化脓性角膜炎
取臭蒲根2两（干品），加水300毫升，文火煎至100毫升，去渣过滤，调整pH值呈中性；或用臭蒲根5两，经水煎、过滤及乙醇反复处理，调整pH至7。均经高压灭菌。用于点眼，每日3次，每次2～3滴；或行眼浴每日1次，每次10分钟。共治角膜溃疡、树枝状角膜炎、角膜灼伤等27例，治愈24例，无效1例，未观察2例。多数在2～6天内治愈。实践证明，本品对促进组织新生，加速溃疡面的愈合，作用较明显。
③治疗菌痢、肠炎
取鲜根切片晒干，研成细末，装入胶囊，每粒0.3克。每次3粒（小儿减半），每天3次，温开水送服。煎服易产生恶心呕吐反应。治疗420例，效果显著。
用量:内服：煎汤，3~6g；或研末装胶囊。外用：煎水洗或研末调敷。