治胃痛，痢疾，二便不畅，风痹，烂脚。①《纲目》："主心痛，煎汁洗风痹。"②姚可成《食物本草》："主利气，散滞血，疗心痛，解热郁。"③《岭南采药录》："果实汁液，用于驱虫剂及防腐剂。"④《现代实用中药》："未熟果液，治胃消化不良，并为营养品，又为发奶剂。熟果，可利大小便，也可治红白痢疾。"⑤《陆川本草》："治手足麻痹，远年烂脚。"
治远年烂脚: 木冬瓜二两，土惹一两，猪脚一条。共煲服。 (《陆川本草》)
1.抗肿瘤作用：番木瓜碱具有杭淋巴性白血病细胞(L1210)的强烈抗癌活性和抗淋巴性白血病 P388和EA肿瘤细胞的适度活性。
2.抗菌和抗寄生虫作用：番木瓜碱在试管内对结核杆菌(H37RV)稍有抑制作用；叶和根有很微弱的杭菌作用，叶柄无效。也有人证明叶及浆汁无抗菌作用，而种子、果实及根有一定的抗菌作用；抗菌成分的最好溶媒是丙酮；含量有季节差异。果实之浸膏稍能延长感染病毒之鸡胚生存期。该植物各种浸膏整体试验时均无抗疟作用。番木瓜碱有杀灭阿米巴原虫的作用， 临床应用其盐酸盐皮下注射亦有效。浆汁及木瓜蛋白酶用于驱除绦虫、蛔虫及鞭虫等有效。后者的杀蛔虫作用已经实验证明。从种子中分离出的异硫氰酸苄酯有驱蛔作用，而且除局部刺激外无任何毒性。番木瓜甙也曾用作驱虫剂。
3.蛋白酶的作用：木瓜蛋白酶，能帮助蛋白消化，可用于慢性消化不良及胃炎等。亦可用于腹腔注射防治粘连，动物试验证明其防治粘连再发的效果比胰蛋白酶好。未成熟果实的浆汁在炭疽病灶中能消化损坏的组织，而健康的组织不受影响；成熟的果实效果较差。木瓜蛋白酶水溶液可溶解小血块，如加入微量谷胱甘肽则溶解更快。也能溶解粘稠的脓；土霉素、金霉素、氯露累、链霉素可延缓这一作用，青霉素、磺胺及 Gastrisin对之则无影响。因此木瓜蛋白酶可用于有坏死组织的创伤、慢性中耳炎，用作溶解白喉伪膜以及烧伤时的酶性清创。木瓜蛋白酶是有效的抗原，无论吸入、内服、注射及局部应用均能发生过敏。它可释放组织胺，静脉注射毒性很大。
4.其他作用：4.1.抗凝作用：静脉注射木瓜蛋白酶可引起组织胺释放，延长血凝时间，防止发生休克。从浆计中获得的蛋白性物质无论试管试验或整体试验均有显着的抗凝作用，在抗凝剂量时(狗，2mg/kg)，对心血管及呼吸系统无明显作用，大剂量对心脏有直接抑制作用。由于过敏及引起回肠痉挛，其治疗应用仍受限制。
4.2.降压作用：番木瓜碱可引起家兔血压下降，对离体蛙心、兔心引起扩张期停止，使蛙后肢血管收缩，兔耳壳、肾脏、小肠及冠状血管舒张。
4.3.抑制平滑肌作用：番木瓜碱抑制肠管(猫、兔及鼠)及气管(豚鼠)平滑肌，对妊娠子宫(兔及豚鼠)及正常子宫(豚鼠)，少量使之兴奋，大量使之麻痹，对骨胳肌则使之麻痹。种子含番木瓜甙及芥子酶(Myrosin)，前者和芥干甙类似，水解后产生刺激性挥发物。
4.4.堕胎作用：果实的浆汁对豚鼠子宫有明显的加强收缩作用，据云种子有堕胎作用，曾用作通经剂及抗刺激剂。
4.5.心脏和中枢抑制作用：番木瓜碱5mg给实验动物静脉注射，可引起血压短暂下降，对心脏有抑制作用，减慢心率，5mg/kg对兔产生毒性反应；此外，有中枢抑制作用。
用量:内服：煎汤，鲜者30~60g；研末1.5~2.4g；或绞汁饮。外用：煎水洗。