清热燥湿，泻火解毒，止血，安胎。用于湿温、暑温胸闷呕恶，湿热痞满，泻痢，黄疸，肺热咳嗽，高热烦渴，血热吐衄，痈肿疮毒，胎动不安。
①治小儿心热惊啼：黄芩（去黑心）、人参各一分。捣罗为散。每服一字匕，竹叶汤调下，不拘时候服。（《圣济总录》黄芩散）②泻肺火，降膈上热痰：片子黄芩，炒，为末，糊丸，或蒸饼丸梧子大。服五十丸。（《丹溪心法》清金丸）③治慢性气管炎：黄芩、葶苈子各等分，共为细末，糖衣为片，每片含生药0.3克，每日三次，每次五片。（内蒙古《中草药新医疗法资料选编》）④治上呼吸道感染，肠炎：黄芩切碎，加四倍量水浸泡四小时，过滤残渣，再加二倍水浸泡两次，合并滤液，用20％明矾液倒入浸液中，调节pH为3.5（每100公斤黄芩，需明矾6～8公斤），产生黄色沉淀，静置四小时，弃去上层清液，将沉淀物装入布袋中加水过滤，烘干，粉碎，造粒打片。每次服二至三片。（辽宁《中草药新医疗法资料选编》）⑤治少阳头痛及太阳头痛，不拘偏正：片黄芩，酒浸透，晒干为末。每服一钱，茶、酒任下。（《兰室秘藏》小清空膏）⑥治太阳与少阳合病，自下利者：黄芩三两，芍药二两，甘草二两（炙），大枣十二枚（擘）。上四味，以水一斗，煮取三升，去滓。温服一升，日再夜一服。（《伤寒论》黄芩汤）⑦治淋，亦主下血：黄芩四两，细切，以水五升，煮取二升，分三服。（《千金翼方》）⑧治吐血衄血，或发或止，皆心脏积热所致：黄芩一两（去心中黑腐），捣细罗为散。每服三钱，以水一中盏，煎至六分。不计时候，和滓温服。（《圣惠方》黄芩散）⑨治崩中下血：黄芩，为细末。每服一钱，烧秤锤淬酒调下。（《本事方》）⑩治妇人四十九岁已后，天癸却行，或过多不止：黄芩心枝条者二两（重用米醋，浸七日，炙干，又浸又炙，如此七次）。为细末，醋糊为丸，如梧桐子大。每服七十丸，空心温酒送下，日进二服。（《瑞竹堂经验方》芩心丸）⑾安胎：白术、黄芩、炒曲。上为末，粥丸，服。（《丹溪心法》）⑿治肝热生翳，不拘大Z’bJL：黄芩一两，淡豉三两，为末。每服三钱，以热猪肝襄吃，温扬送下，日二撮。忌酒，面。（（卫生家宝方））⒀治眉眶痛，属风热与痰：黄芩（酒漫，炒）、白芷。上为末，茶清调二钱。（（丹溪心法））⒁治灸疮血出：酒炒黄芩二钱。为末，酒服。（（怪证奇方》）⒂治火丹：杵黄芩末，水调敷之。（（G阴沸验方））⒃治产后血渴，饮水不止：黄芩（新瓦上焙干）、麦门冬（去心）各半两。上件，细切。每服三钱，水一盏半，煎至八分，去滓温服，不拘时候。（倘氏家藏方）
①《药对》："黄芩，得厚朴、黄连止腹痛；得五味子、牡蒙、牡蛎令人有子；得黄芪、白蔹、赤小豆疗鼠瘘。"
②《本草图经》："张仲景治伤寒心下痞满，泻心汤四方皆用黄芩，以其主诸热，利小肠故也。又太阳病下之利不止，有葛根黄芩黄连汤，及主妊娠安胎散，亦多用黄芩。"
③《医学启源》："黄芩，治肺中湿热，疗上热目中肿赤，瘀血壅盛，必用之药。泄肺中火邪上逆于膈上，补膀胱之寒水不足，乃滋其化源。《主治秘诀》云，其用有九：泻肺经热，一也；夏月须用，二也；上焦及皮肤风热，三也；去诸热，四也；妇人产后，养阴退阳，五也；利胸中气，六也；消膈上痰，七也；除上焦热及脾湿，八也；安胎，九也。单制、二制、不制，分上中下也。酒炒上行，主上部积血，非此不能除，肺苦气上逆，急食苦以泄之，正谓此也。"
④张元素："下痢脓血稠粘，腹痛后重，身热久不可者，黄芩与芍药、甘草同用。肌热及去痰用黄芩，上焦湿热亦用黄芩，泻肺火故也。疮痛不可忍者，用苦寒药，如黄芩、黄连，详上下，分梢根，及引经药用之。"
⑤李杲："黄芩，味苦而薄，故能泄肺火而解肌热，手太阴剂也。细实而中不空者，治下部妙。"
⑥朱震亨："黄芩降痰，假其降火也。凡去上焦湿热，须以酒洗过用。片芩泻肺火，须用桑白皮佐之。若肺虚者，多用则伤肺，必先以天门冬保定肺气，而后用之。黄芩、白术乃安胎圣药，俗以黄芩为寒而不敢用，盖不知胎孕宜清热凉血，血不妄行，乃能养胎，黄芩乃上、中二焦药，能降火下行，白术能补脾也。"
⑦《纲目》："洁古张氏言黄芩泻肺火，治脾湿；东垣李氏言片芩治肺火，条芩治大肠火；丹溪朱氏言黄芩治上中二焦火；而张仲景治少阳证小柴胡汤，太阳、少阳合病下利黄芩汤，少阳证下后心下满而不痛泻心汤并用之；成无己言黄芩苦而入心，泄痞热，是黄芩能入手少阴、阳明、手足大阴、少阳六经典。盖黄芩气寒味苦，苦人心，寒胜热，泻心火，治脾之湿热，一则金不受刑，一则胃火不流入肺，即所以救肺也；肺虚不宜者，苦寒伤脾胃，损其母也。……杨士瀛《直指方》云，柴胡退热，不及黄芩，盖亦不知柴胡之退热，乃苦以发之，散火之标也，黄芩之退热，乃寒能胜热，折火之本也。""黄芩得酒上行，得猪胆汁除肝胆热，得柴胡退寒热，得芍药治下痢，得桑白皮泻肺火，得白术安胎。"
⑧《本草经疏》："黄芩，其性清肃，所以除邪；味苦所以燥湿；阴寒所以胜热，故主诸热。诸热者，邪热与湿热也，黄疸、肠澼、泄痢，皆温热胜之病也，折其本，则诸病自瘳矣。苦寒能除湿热，所以小肠利而水自逐，源清则流洁也。血闭者，实热在血分，即热入血室，令人经闭不通，湿热解，则荣气清而自行也。恶疮疽蚀者，血热则留结，而为痈肿溃烂也；火疡者，火气伤血也，凉血除热，则自愈也。《别录》消痰热者，热在胸中，则生痰火，在少腹则绞痛，小儿内热则腹痛，胃中湿热去，则胃安而消谷也。淋露下血，是热在阴分也；其治往来寒热者，邪在少阳也；五淋者，湿热胜所致也；苦寒清肃之气胜，则邪气自解，是伐其本也。""黄芩为苦寒清肃之药，功在除热邪，而非补益之品，当与黄连并列，虽能清热利湿消痰，然苦寒能损胃气而伤脾阴，脾肺虚热者忌之。"
⑨《本草汇言》："清肌退热，柴胡最佳，然无黄芩不能凉肌达表。上焦之火，山栀可降，然舍黄芩不能上清头目。……所以方脉科以之清肌退热，疮疡科以之解毒生肌，光明科以之散热明目，妇女科以之安胎理经，此盖诸科半表半里之首剂也。"
⑩《药品化义》："黄芩中枯者名枯芩，条细者名条芩，一品宜分两用。盖枯芩体轻主浮，专泻肺胃上焦之火，主治胸中逆气，膈上热痰，咳嗽喘急，目赤齿痛，吐衄失血，发斑发黄，痘疹疮毒，以其大能凉膈也。其条芩体重主降，专泻大肠下焦之火，主治大便闭结，小便淋浊，小腹急胀，肠红痢疾，血热崩中，胎漏下血，挟热腹痛，谵语狂言，以其能清大肠也。"
⑾《本经逢原》："昔人以柴胡去热不及黄芩，盖柴胡专主少阳往来寒热，少阳为枢，非柴胡不能宣通中外；黄芩专主阳明蒸热，阳明居中，非黄芩不能开泄蕴著，一主风木客邪，一主湿土蕴著，讵可混论。芩虽苦寒，毕竟治标之药，惟躯壳热者宜之，若阴虚伏热，虚阳发霉，可轻试乎?其条实者兼行冲脉，治血热妄行，古方有一味子芩丸，治女人血热，经水暴下不止者，最效。"
⑿《本经疏证》："仲景用黄芩有三耦焉，气分热结者，与柴胡为耦（小柴胡汤、大柴胡汤、柴胡桂枝干姜汤、柴胡桂枝汤）；血分热结者，与芍药为耦（桂枝柴胡汤、黄芩汤、大柴胡汤、黄连阿胶汤、鳖甲煎丸、大黄蟅虫丸、奔豚汤、王不留行散、当归散）；湿热阻中者，与黄连为耦（半夏泻心汤、甘草泻心汤、生姜泻心汤、葛根黄芩黄连汤、干姜黄芩黄连人参汤）。以柴胡能开气分之结，不能泄气分之热，芍药能开血分之结，不能清迫血之热，黄连能治湿生之热，不能治热生之湿。譬之解斗，但去其斗者，未平其致斗之怒，斗终未巳也。故黄芩协柴胡，能清气分之热，协芍药，能泄迫血之热，协黄连，能解热生之湿也。"
①治疗小儿急性呼吸道感染
用50％黄芩煎液，1岁以下每天6毫升，1岁以上8～10毫升，5岁以上酌加，皆分3次服。经治急性上呼吸道感染51例，急性支气管炎11例，急性扁桃体炎1例。治后体温降至正常、症状消失者51例，无效12例。体温多在3天内恢复正常，症状消失多为4天。
②治疗慢性气管炎
取黄芩1斤，甘草0.5斤，加水煎煮2次，得煎液3斤；另取生石灰1斤，加冷开水10斤，搅拌浸泡静置24小时，取上清液8斤。将煎液缓缓加入石灰水中，边加边搅拌，至pH呈7～8为止。每次20～25毫升，日服3次。治疗35例，临床治愈2例，显效16例。对单纯型疗效较好。
③治疗急性菌痢
取黄芩、诃子等量，以明矾沉淀法提制成粉。每次2克，日服4次，小儿酌减。对症治疗：失水者补液，高热者配合解热剂。治疗100例，平均2.5天症状消失，3.3天大便镜检正常，4.3天大便培养转阴，5.3天临床治愈。
④治疗钩端螺旋体病
取黄芩、银花、连翘等量，分别制成黄芩素及银花、连翘浸膏，混合制成片剂，每片重0.5克，相当于生药3.7克。每次10～15片，6小时服1次，小儿酌减。共治65例，其中一个地区收治59例，治愈58例；另一地区收治6例，失败4例，疗效差异甚大，原因有待研究。有效病例服药后，开始降温时间平均为7.5小时，体温恢复正常时间平均为1.8天，临床症状和体征大多在2～5天内减轻或消失。以对中、轻度病人疗效较好，退热较快，对重度晚期病人退热较慢，疗效较差。服药期间未见严重毒性反应，仅少数病例有轻微恶心、呕吐及腹泻现象，停药后即可消失。
⑤治疗传染性肝炎
将黄芩的提取物-黄芩素装胶囊，每粒0.25克。每次2粒，日服3次，儿童酌减。治疗急性传染性肝炎27例，自觉症状和体征均于1月内消失，肝功能恢复正常。其中治疗半月，谷丙转氨酶即降至正常者占74.1％。亦有用黄芩素针剂，每日肌注2毫升（含黄芩素40毫克），1个月为一疗程，治疗急性无黄疸型肝炎13例，基本治愈4例，显效1例，有效6例。另曾配合胎盘组织液每天肌注2毫升，有腹水者配合利尿剂，治疗迁延性肝炎7例，基本治愈4例，显效1例，有效2例；治疗慢性肝炎47例，基本治愈13例，显效6例，有效14例，无效14例。未见明显副作用。
⑥治疗肾炎、肾盂肾炎
用黄芩提取物制成5％黄芩素注射液，每次肌注100～200毫克（儿童减半），每日2次。共治20例，治疗期间除配合卧床休息、低盐饮食外，均未兼用其他药物。结果急性肾炎11例，治愈（临床症状完全消失；复查尿液两次以上均正常）6例，好转（临床症状完全消失，复查尿液仅有少量红、白细胞）5例；肾盂肾炎9例，治愈、好转（标准同上）各4例，1例用药10天无变化。疗程最长17.5天，最短7天，平均12.5天。治愈病例临床症状的消失时间平均为9天，尿检恢复正常时间平均为15.6天。黄芩治疗肾病所以奏效，可能与其具有抗菌、降血压、利水等作用有关。
⑦治疗高血压病
将黄芩制成20％的酊剂，每次5～10毫升，日服3次。治疗51例，服药前血压均在180/100毫米汞柱以上，服药1～12月后血压下降20/10毫米汞柱以上者占70％以上。一般临床症状也随之消失或减轻。据观察，本药虽经较长时期服用，仍能发挥继续降压作用。无明显副作用。
此外，以黄芩煎荆预防猩红热，黄芩含片预防白喉，有一定作用。
①抗炎抗变态反应
黄芩甙、黄芩甙元对豚鼠寓体气管过敏性收缩及整体动物过敏性气喘，均有缓解作用，并与麻黄碱表现协同。甙元的磷酸钠盐较硫酸钠盐作用强，黄芩甙元能抑制离体气管及回肠之Sehultz-Dale反应，对豚鼠被动性皮肤过敏反应、组织胺皮肤反应亦表现抑制，在抗变态反应方面，甙元较甙作用强。黄芩此种抗变态反应，是由于伤害了肥大细胞的酶激活系统（SH-酶），抑制了过敏性介体的释放，因而不产生过敏反应，此外它对平滑肌本身，也有直接的松弛作用。黄芩甙元及黄芩甙均能抑制过敏性之浮肿及炎症，二者并能降低小鼠：耳毛细血管的通透性，后者尚能防止低气压引起的小白鼠肺出血。
②抗微生物作用
黄芩有较广的抗菌谱，在试管内对痢疾杆菌、白喉杆菌、绿脓杆菌、葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌以及脑膜炎球菌等均有抑制作用，煎剂作喉头喷雾，对脑膜炎带菌者亦有效，即使对青霉素等抗菌素已产生抗药性的金黄色葡萄球菌，对黄芩仍属敏感。试管内对人型结核杆菌的抑制作用，报告不一致，煎剂对小白鼠实验性结核病有效，但对豚鼠则无效。试管内对流感病毒PR株有抑制作用，鼠痞染病毒后，能使之减轻肺部损伤和延长存活日期。对多种皮肤致病性真菌，体外亦有抑制效力，并能杀死钩端螺旋体。
③解热作用
早年报告，对疫苗引起发热的家兔静脉注射6％黄芩浸剂4～6毫升，有解热作用，以后有人用大剂量黄芩水煎剂（比上述报告静脉注射黄芩浸剂之量大4～30倍）口服或肌肉住射均未能证实有解热作用，如静脉注射则有轻微解热作用，此情况与静脉注射生理盐水一样，黄芩5克/公斤亦不能使热穿刺法致热的家兔退热。但腹腔或静脉注射黄芩甙，口服黄芩煎剂，对疫苗或酵母致热的家兔均能解热。上述研究结果不一致，可能由于植物来源多未作生药学检定，品种混乱，粗制剂静脉注射影响血压，亦能干扰解热作用。因此黄芩是否有解热性质，有待进一步研究。黄芩提取物对正常家兔无降温作用。
④降压、利尿作用
黄芩酊剂、浸剂、煎剂、醇或水提取物、黄芩甙对麻醉犬、猫、兔静脉、肌肉注射或灌胃，均可引起降压作用。浸剂口服能降低正常及慢性肾性高血压犬的血压，酊剂可使神经性高血压犬血压回至正常。浸剂口服的降压作用，以云南产者为最佳，河北次之，西北的较差。黄芩的降压原理，一般认为系直接扩张血管，也可能作用于血管感受器，反射地引起降压。黄芩同属植物Scutellaria galericulata则无降压作用。
在急性利尿实验中，黄芩甙元作用最强，汉黄芩素次之，黄芩甙更差。黄芩醇提取物及煎剂（正常人及家兔）亦有利尿作用。
⑤对血脂及血糖的作用
黄芩及三黄制剂（黄连：黄芩：大黄为1：1：1）对正常家兔血清中总胆甾醇/总磷脂之比值无影响，但能降低饲养胆甾醇7周后家兔的此种比值，对切除甲状腺家兔的此种比值，三黄制剂亦能降低之。黄芩能使血糖轻度上升。
⑥和胆，解痉作用
黄芩煎剂和乙醇提取液可增加犬、兔胆汁排泄量，黄芩甙元较黄芩甙作用明显，汉黄芩素无影响；黄芩甙使结扎总输胆管的家兔在1～6小时内胆红素（较对照组）增高，但24～48小时后则使之降低。黄芩酊剂、煎剂对在位肠管有明显的抑制作用，酊剂可拮抗毛果芸香碱引起的肠管运动增强现象，切断迷走神经后并不影响其作用，用小白鼠小肠段进行解痉的效价测定，汉黄芩素只有弱的解痉作用，黄芩甙元则无解痉效力。
⑦镇静作用
黄芩甙能抑制小白鼠的自发活动，作用强度与剂量有关，黄芩煎剂可抑制小鼠阳性条件反射，此作用可能是由于它加强了皮层抑制过程所致，可用于神经兴奋性增高及失眠的高血压患者。
⑧其他作用
黄芩根茎的酊剂静脉注射，对士的宁中毒的蛙、猫、狗，可消除强直性痉挛的症状，并使动物免于死亡。黄芩甙、葡萄糖醛酸可降低小鼠士的宁中毒死亡率，前者10毫克就能提高其半数致死量约2.5倍。从测定四氯化碳中毒小鼠的肝糖元含量，以葡萄糖醛酸组含量较高，黄芩甙次之，黄芩甙元最低。
用量:3～9g。