清湿热，除骨蒸，消疳热。用于湿热泻痢，黄疸，痔疾，骨蒸潮热，小儿疳热。
①治肥疳热:川黄连五钱，胡黄连五饯，朱砂一钱（另研）。上二物为细末，入朱砂末，都填入猪胆内，用淡浆水煮，以杖于铫子上用线钓之，勿着底，候一炊久取出，研入芦荟、麝香各一分，饭和丸如麻子大。每服五、七丸至二、三十丸，米饮下，食后。（《小儿药证直诀》胡黄连丸）②治小儿疳热，肚胀，潮热，发焦:胡黄连五钱，灵脂一两。为末，雄猪胆汁和丸绿豆大。米饮服，每服一、二十丸。（《全幼心鉴》）③治痢血:胡黄连、乌梅肉、灶下土等分。为末。腊茶清调下，食前、空腹温服。（《苏沈良方》三物散）④治热痢腹痛:胡黄连末，饭丸梧子大。每米汤下三十丸。（《鲜于枢钩玄》）⑤治伤寒劳复身热，大小便赤如血色者:胡黄连一两，山栀子二两（去皮，入蜜半两拌和，炒令微焦）。二味捣罗为末，猪胆汁和丸如梧桐子大。每服用生姜二片，乌梅一个，童子小便三合，漫半日，去滓，食后暖小便令温下十丸，临卧再服。（《本草图经》）⑥治小儿盗汗，潮热往来:胡黄连，柴胡等分。罗极细，炼蜜和丸如鸡头大。每服二丸至三丸，银器中用酒少许化开，更入水五分，重汤煮三二十沸，放温，食后和滓服。（孙用和）⑦治吐血、衄血:生地黄、胡黄连各等分。上为末，用猪胆汁为丸如梧桐子大。每服五十丸，临卧煎茅花汤送下。（《普济方》胡黄连散）⑧治婴儿赤目:茶调胡黄连末，涂手足心。（《济急仙方》）⑨治痔疮疼肿，不可忍者:胡黄连末，鹅胆汁调涂之.（《孙天仁集效方》）⑩治痔漏成管:胡黄连（净末）一两，穿山甲（麻油内煮黄色）、石决明（煅）、槐花（微炒）各末五钱。炼蜜丸如麻子大。每服一钱，空心，清米汤送下，早、晚日进二服，至重者四十日而愈。此方不用针刀挂线，不受苦楚。如漏之四边有硬肉突起者，加蚕茧二十个炒末，和入药中，比及遍身诸漏皆效。（《外科正宗》黄连闭管丸）⑾治痈疳疮肿，已溃未溃者皆可用之:胡黄连、穿山甲（烧存性）等分为末。以茶或鸡子清调涂。（《简易方论》）⑿治杨梅疮毒:胡黄连、猪胰同煮服。（《本草求原》）
①《本草经疏》:"胡黄连，善除湿热，故主久痢成疳及冷热泄痢，厚肠胃。伤寒咳嗽者，邪热在手太阴、足阳明也。温疟骨蒸者，热在骨间也。理腰肾、去阴汗者，肾虚湿热下流客之，使热伏肾间也。小儿惊痫、寒热、不下食者，热则生风，故发惊痫，热在胃口，故不下食也。心主五色，脾胃主肌肉，二经湿热去，则颜色自佳也。三消五痔，大人五心烦热者，无非湿热在肠胃及火在五脏间也。大寒至苦，极清之性，能清热，自肠胃以次于骨，一切湿热、邪热，阴分伏热所生诸病，莫不消除。""胡黄连，气味苦寒之至，设使阴血太虚，真精耗竭而胃气脾阴俱弱者，虽见如上诸证，亦勿轻投，即欲用之，亦须健脾安胃等药同用，乃可无弊，填之。"
②《药品化义》:"胡黄连，独入血分而清热。丹溪云，骨蒸发热，皆积所成。此能凉血益阴，其功独胜，若夜则发热，昼则明了，是热在血分，以此佐芎、归为二连汤，除热神妙。"
③《本经逢原》:"胡黄连，苦寒而降，大伐脏腑骨髓邪热，除妇人胎蒸、小儿疳热积气之峻药。同乌梅止小儿血痢，同鸡肝治小儿疳眼，同猪胰疗杨梅疮毒，同干姜治果子积，皆取伐肝、肾热邪也。小儿肾气本实，故可当此，若脾、胃、肾脏不足者服之，夺人天元，为害不浅。惟霉疮用胡黄连直达下焦，善搜淫火之毒。"
④《本草正义》:"按胡连之用，悉与川连同功。惟沉降之性尤速，故清导下焦湿热，其力愈专，其效较川连为捷。凡热痢脱肛，痔漏疮疡，血痢血淋，溲血泻血及梅毒疳疮等证，湿火结聚，非此不能直达病所，而小儿疳积腹膨之实证，亦可用之。盖苦降直坠，导热下趋，最为迅疾，且不致久留中州，妨碍脾胃冲和之气耳。""胡连大苦大寒，纯阴用事，且较川连尤为峻烈。自苏恭有主妇人胎热之说，而后之《本草》皆仍其旧，须知胎前实火，止是百病中之一端，惟妊身养胎，最重脾胃，苦寒较药，胡可轻投。苏恭又以治骨蒸劳瘵，则热入骨髓，精血巳枯，虽曰火炎，实由阴竭，大寒大苦，戕伐生机，火纵可息，而大命何如?适以速之蹶耳。缪氏《经梳》又谓主久痢成疳，似以小儿疳劳言之，然久痢之余，岂可峻用苦寒，再戕脾气！"
胡黄连水漫剂（1:4）在试管内对蓝色毛癣苗等皮肤真菌有不同程度抑制作用。根的提取物有利胆、抗菌作用，可用于肝炎及尿路感染。
用量:1.5～9g。