清热解毒，凉血利咽。用于温毒发斑，舌绛紫暗，痄腮，喉痹，烂喉丹痧，大头瘟疫，丹毒，痈肿。
①治流行性感冒：板蓝根一两，羌活五钱。煎汤，一日二次分服，连服二至三日。（《江苏验方草药选编》）②治大头天行，初觉憎寒体重，次传头面肿盛，目不能开，上喘，咽喉不利，口渴舌燥：黄芩（酒炒）、黄连（酒炒）五钱，陈皮（去白）、甘草（生用）、玄参二钱，连翘、板蓝根、马勃、鼠粘子、薄荷一钱，僵蚕、升麻七分，柴胡、桔梗二钱。为末汤调，时时服之，或蜜拌为丸，噙化。（李杲，普济消毒饮）③预防流行性腮腺炎：板蓝根、山茨菇各一两，连翘八钱，甘草六钱，青黛一钱（冲服）。上药用水浸泡半小时，放入大砂锅内，放清水800～1000毫升，煎成500毫升，分为10份，装入小瓶。4岁以上儿童每天服一次，每次15毫升；1～3岁每次服10毫升，每天一次，温服。（《全展选编·爱国卫生》）④治肝炎：板蓝根一两。水煎服。（《辽宁常用中草药手册》）⑤治肝硬化：板蓝根一两，茵陈四钱，郁金二钱，苡米三钱。水煎服。（《辽宁常用中草药手册》）⑥治痘疹出不快：板蓝根一两，甘草三分（锉，炒）。上同为细末，每服半钱或一钱，取雄鸡冠血三两点，同温酒少许，食后，同调下。（《阎氏小儿方论》）
《本草便读》：板蓝根即靛青根，其功用性味与靛青叶同，能入肝胃血分，不过清热、解毒、辟疫、杀虫四者而已。但叶主散，根主降，此又同中之异耳。
①防治流行性乙型脑炎
预防用板蓝根3钱煎服，每日1剂，连服5天。治疗用50％或200％板蓝根注射液每次2毫升肌肉注射，每日2～3次。或用板蓝根煎服，昏迷者行鼻饲，12岁以下每日2两，13岁以上2～4两，1次顿服或2次分服，连服2～3周；亦可每2小时服1次，成人每次用2～2.5钱，15岁以下用1～2钱，待体温降至正常后酌减剂量及次数，2天后停药。治疗过程中需配合必要的针灸、西药等对症处理及支持疗法。据临床观察，板蓝根具有清热解毒、消除早期炎性改变，使邪热外达的功效。早期应用，同时配合对症处理，可大大提高治疗效果。据190例的观察，治愈率在90％以上。绝大多数病例于3天内退热：临床症状除特别严重者外，通常均能在退热后即消失；少数有后遗症，均系疾病过程中持续高热、严重昏迷和抽搐的病例。
②防治流行性腮腺炎
用板蓝根2～4两，小儿减半，每日1剂煎服。同时可将板蓝根配成30％溶液涂患处。据387例的观察结果，除5例好转、5例无效外，其余均治愈。对伴有并发症者效果较差。预防服药11295人次，似有控制流行的作用。
③治疗感冒（包括"流感"）
用100％板蓝根注射液肌肉注射，视年龄及病情每次1～6毫升，每日2～4次。治疗80例，治愈78例，无效2例（其中1例合并肺炎）。一般在1～3天退热，2～5天症状消失。
④治疗传染性肝炎
用板蓝根1两，每日1剂煎服；或用板蓝根6斤、蒲公英3斤，糖适量，制成煎剂1000毫升，日服2次，每次50毫升，15～20天为一疗程。单味煎剂治疗8例均获效果，症状消失平均时间为6天，肝功能恢复为15.7天，肝脏缩小为13天。疗效优于茵陈蒿汤对照组。复方煎剂治疗50例，经一个疗程后有50％病例肝功能恢复正常，第一、二疗程累计肝功能恢复正常者达92％。
⑤治疗暴发性红眼
用板蓝根制成10％或5％眼药水，每日滴眼4次。观察235例，4天内治愈率达94.9％。多数病例用药（10％浓度）1天后球结膜水肿消失或好转，自觉症状减轻或消失。治疗早、病情轻者疗效最好。药液浓度10％的比5％的效果好。
⑥治疗单纯性疱疹性口炎
取板蓝根l两，制成60毫升煎液，1～3岁小儿每次10～20毫升，日服3次。治疗11例，均于第2、3天热退、流涎停止、充血消失、坏死上皮脱落，第4、5天见粘膜再生、溃疡愈合。
⑦治疗扁平疣等
用50％板蓝根注射剂肌肉注射，每次2毫升，每月1～2次，10～20天为一疗程。儿童可用成人剂量。观察45例，39例获得治愈或进步。一般于2～15天开始见效，治愈时间7～45天不等。但皮损较多、范围较广泛者多无效果。
此外，用板蓝根煎剂治疗非典型性肺炎、流行性脑脊髓膜炎、白喉，用板蓝根配合大青叶、羌活治疗上呼吸道感染，用板蓝根肌肉注射治疗带状疱疹、单纯疱疹及流行性腹泻等，均有不同程度的疗效。曾有报道，1例上呼吸道炎患者肌注板蓝根注射液2毫升后15分钟，即出现头晕眼花，胸闷气短，心慌烦乱，四肢麻木、发胀、奇痒，两前臂及两小腿满布荨麻疹等过敏反应现象，经及时处理后恢复。
①抗菌抗病毒作用
菘蓝根对多种细菌有作用。水浸液对枯草杆菌、金黄色葡萄球菌、八联球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、副伤寒甲杆菌、痢疾（志贺氏、弗氏）杆菌、肠炎杆菌等都有抑制作用；丙酮浸出液也有类似作用，且对溶血性链球菌有效（皆用琼脂小孔平板法）。对A型脑膜炎球菌之抑菌作用与大蒜、金银花相似。板蓝根、大青叶抗菌、抗病毒的有效成分，有人认为是靛甙。实验证明，靛甙在体内外皆无抗菌作用；体外抗病毒作用亦不突出；在体内排泄又快，故认为它无明显生理和抗菌的活性作用。其有效成分尚待研究。
②抗钩端螺旋体作用
1：100以上的板蓝根或大青叶，在试管内均有杀钩端螺旋体的作用。
③解毒作用
据报道，犬用板蓝根、黄连粉与藜芦同服（各2.0克／公斤），能解藜芦毒，降低死亡率；若藜芦中毒后再用之，则无效；分别单用板蓝根粉或黄连粉，效果亦不好。
用量:9～15g。